中科院借助NVIDIATesla完成首次H1N1病毒模拟

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NVIDIA近日宣布，中国科学研究院的研究人员们运用NVIDIA Tesla GPU加速处理器完成了全球第一次原子级完整H1N1流行性感冒病毒的计算机仿真模拟，为流行性感冒预防方法的研究取得重要突破。在以往，由于细菌和病毒反应作用快速，而且不容易撷取，在实验室实验内研究各种细菌和病毒是非常困难的，而且难有适合模拟数十亿粒子的环境条件，因此从前超级计算机的能力都无法做到这些系统的计算机模拟。

NVIDIA表示，中国科学研究院过程工程研究所早前采用了一台288个服务器节点、搭载2200多颗NVIDIA Tesla GPU处理器的Mole-8.5超级计算机，为分子动力学仿真作为“运算显微镜”，探视H1N1病毒的原子结构，使得研究人员能够仿真完整的H1N1流行性感冒病毒，有助在验证有关这项病毒的理论性和实验性理解。

据了解，研究人员开发了一个可运用GPU加速的分子动力学仿真应用程序，并在Mole-8.5 GPU超级计算机上执行，系统可整合1飞秒的积分时间间隔，为3亿个原子或基(radical)进行每天770皮秒的模拟。

中科院过程工程研究所助理教授任瑛博士表示， Mole-8.5 GPU超级计算机实现了许多从前无法做到的科学研究，对于发展更有效的传染病控制方法和设计预防药物而言都是非常重要的一步。

除了H1N1流行性感冒病毒之外，目前中国正运用搭载GPU的高速运算系统进行众多科学研究，包括模拟气流是研究暴风雨形成到化学产业混合过程的核 心环节、运用天河一号A超级计算机模拟长波辐射物理模式、为各种融合能源模拟的Gyrokinetic Torodial Code软件程序进行加速运算等。