1111例全球新冠基因组谱系图新变化

[newM]

病毒基因复制会有差错造成变异。 因此传播的代数越多，复制的次数越多，产生差错机会越多，变异就越多。后面的变异多数是在上一代基因基础上叠加的 。也就是说后代保留上代的变异再接着发生新的变异。因此就可以通过比较基因序列找出先后传播顺序，有新变异的是后代, 然后溯源到最初始传播的基因。

 

[lfe634]

我也不是專家，但是至少從他網站的設計上可以看出來：

這個研究的思路是，因為樣本裡頭武漢的最早，而且樣本都在早期，所以就把武漢病毒設定成病毒的祖先，然後依次推理出其他分支，和武漢病毒完全一樣的叫做｢沒有基因突變｣，突變越多的越不武漢，離中心越遠。這個研究的前提就是武漢發源 (雖然直覺上就是這樣)，但是就像｢聖經上面寫著神存在，因此神存在｣這樣的說法，我們不能拿聖經去證明神的存在。

相似而且屬於高中至大學程度的，是腺粒體追溯人類自東非的遷徙的研究。比較腺粒體的基因，出現一個很明顯的現象：當今非洲人的腺粒體多樣性最高，而且大多是其他地方都看不到的。因為當初智人只有少數幾個分支走出非洲，並且散布到各地。剩下的還在本地繼續演化。也就是說，隨機黃種人甲與白人乙之間的基因差異，比黑人甲與黑人乙之間的還要少。

放在這個新冠框架下，如果我們從武漢今天尚存的本土病人身上採樣，發現病毒多樣性高，擁有許多其他地方沒有的分支，而此時美國病毒自成一群，意大利病毒又自成一群等等，那這樣的證據就明顯指向武漢發源。

從網站上的證據看，武漢樣本倒自成緊密的一群 (是否也是研究設定？)，這反而讓武漢看起像一個後來才出現的分支。如果真的是武漢起源，放回智人遷徙的框架，就好比說，當年非洲剛出現智人亞當夏娃，第一代兒女就去佔領世界各大洲了。當然武漢是現代大都會，病毒一上身就上飛機散播各大洲，也不是不可能。但是武漢真的沒有｢其他地方都沒有｣的一些病毒分支被發現嗎？亞當夏娃留在非洲的其他子孫難道都是克隆人？難道是來不及出現、採樣，就被隔離消滅了？

光是從時間爆發來看，的確像是武漢起源。當然真正的起源地可能已經爆發，只是當成流感來處理了。有些地方八十歲以上老人不夠，各種呼吸道病橫行，今年也看不出有什麼特別高的死亡率。而美國就算是起源地，是否會把新冠當成流感？難道美帝就沒有眼科醫生李文亮能慧眼識病毒，發出警告？我覺得可能性不高。

但大概率在下個月美國就是要把新冠當成流感來復工的，即使殊途也得同歸，沒差了。

 

[Mr.CFC*]

这篇文章就是帮助你了解一点新冠病毒的科学事实。然后，你是否能尊重事实、承认事实，这是个人甚至国家的价值取向。”

————
一语惊醒所有人

 

[wilson111]

有一点没看懂，基因有29000个，每个病毒在A点发生突变的概率是1/29000，但是如果两个是不相关的话，那么他们都在A发生突变的概率不应该是两者的乘积么？怎么还是1/29000?估计这之后的分析都不用看了，一开始的基础就错了

 

[lfe634]

有一点没看懂，基因有29000个，每个病毒在A点发生突变的概率是1/29000，但是如果两个是不相关的话，那么他们都在A发生突变的概率不应该是两者的乘积么？怎么还是1/29000?估计这之后的分析都不用看了，一开始的基础就错了

那個數學挺怪的，發生突變還需要發生一樣的突變 (如 A 換成 T 而不是換成 C 或 G)，而發生某種特定突變的機率，還要考慮進其他這麼多鹼基都沒突變的機率，這與與全體基因組總共有幾個鹼基對是沒有關係的。就像渥太華有一萬個肚子裡的嬰兒，與某個嬰兒有唐氏症，但沒其他毛病的機率是沒有關係的，假設是千分之一吧。而第二個嬰兒有唐氏症而沒其他毛病又是一樣的千分之一。也就是原文再用 1/29000 的意思了。

數學有問題，但道理應該是可以接受的，發生同樣突變的可能性低到可以忽略不計了。也就是這種基因測序分析可以推敲出來病毒的族譜。但研究的先決條件已經規定是武漢起源了。

另外，新冠病毒只有 15 個基因。一個基因幾百個胺基酸，一個胺基酸三個鹼基對，還有基因中間填充的鹼基對。所以一共三萬個 (29000?) 鹼基對。

 

[lindamy]

我也不是專家，但是至少從他網站的設計上可以看出來：

這個研究的思路是，因為樣本裡頭武漢的最早，而且樣本都在早期，所以就把武漢病毒設定成病毒的祖先，然後依次推理出其他分支，和武漢病毒完全一樣的叫做｢沒有基因突變｣，突變越多的越不武漢，離中心越遠。這個研究的前提就是武漢發源 (雖然直覺上就是這樣)，但是就像｢聖經上面寫著神存在，因此神存在｣這樣的說法，我們不能拿聖經去證明神的存在。

相似而且屬於高中至大學程度的，是腺粒體追溯人類自東非的遷徙的研究。比較腺粒體的基因，出現一個很明顯的現象：當今非洲人的腺粒體多樣性最高，而且大多是其他地方都看不到的。因為當初智人只有少數幾個分支走出非洲，並且散布到各地。剩下的還在本地繼續演化。也就是說，隨機黃種人甲與白人乙之間的基因差異，比黑人甲與黑人乙之間的還要少。

放在這個新冠框架下，如果我們從武漢今天尚存的本土病人身上採樣，發現病毒多樣性高，擁有許多其他地方沒有的分支，而此時美國病毒自成一群，意大利病毒又自成一群等等，那這樣的證據就明顯指向武漢發源。

從網站上的證據看，武漢樣本倒自成緊密的一群 (是否也是研究設定？)，這反而讓武漢看起像一個後來才出現的分支。如果真的是武漢起源，放回智人遷徙的框架，就好比說，當年非洲剛出現智人亞當夏娃，第一代兒女就去佔領世界各大洲了。當然武漢是現代大都會，病毒一上身就上飛機散播各大洲，也不是不可能。但是武漢真的沒有｢其他地方都沒有｣的一些病毒分支被發現嗎？亞當夏娃留在非洲的其他子孫難道都是克隆人？難道是來不及出現、採樣，就被隔離消滅了？

光是從時間爆發來看，的確像是武漢起源。當然真正的起源地可能已經爆發，只是當成流感來處理了。有些地方八十歲以上老人不夠，各種呼吸道病橫行，今年也看不出有什麼特別高的死亡率。而美國就算是起源地，是否會把新冠當成流感？難道美帝就沒有眼科醫生李文亮能慧眼識病毒，發出警告？我覺得可能性不高。

但大概率在下個月美國就是要把新冠當成流感來復工的，即使殊途也得同歸，沒差了。

我也是一点不懂。难得能得到你这么详细的大作，算是没有白贴。

我转过来的很多文章，自己不懂，或者并不支持作者的观点，只是希望能为懂行的，提供方便，发表高见。

谢谢！

 

[lindamy]

我也不是專家，但是至少從他網站的設計上可以看出來：

這個研究的思路是，因為樣本裡頭武漢的最早，而且樣本都在早期，所以就把武漢病毒設定成病毒的祖先，然後依次推理出其他分支，和武漢病毒完全一樣的叫做｢沒有基因突變｣，突變越多的越不武漢，離中心越遠。這個研究的前提就是武漢發源 (雖然直覺上就是這樣)，但是就像｢聖經上面寫著神存在，因此神存在｣這樣的說法，我們不能拿聖經去證明神的存在。

相似而且屬於高中至大學程度的，是腺粒體追溯人類自東非的遷徙的研究。比較腺粒體的基因，出現一個很明顯的現象：當今非洲人的腺粒體多樣性最高，而且大多是其他地方都看不到的。因為當初智人只有少數幾個分支走出非洲，並且散布到各地。剩下的還在本地繼續演化。也就是說，隨機黃種人甲與白人乙之間的基因差異，比黑人甲與黑人乙之間的還要少。

放在這個新冠框架下，如果我們從武漢今天尚存的本土病人身上採樣，發現病毒多樣性高，擁有許多其他地方沒有的分支，而此時美國病毒自成一群，意大利病毒又自成一群等等，那這樣的證據就明顯指向武漢發源。

從網站上的證據看，武漢樣本倒自成緊密的一群 (是否也是研究設定？)，這反而讓武漢看起像一個後來才出現的分支。如果真的是武漢起源，放回智人遷徙的框架，就好比說，當年非洲剛出現智人亞當夏娃，第一代兒女就去佔領世界各大洲了。當然武漢是現代大都會，病毒一上身就上飛機散播各大洲，也不是不可能。但是武漢真的沒有｢其他地方都沒有｣的一些病毒分支被發現嗎？亞當夏娃留在非洲的其他子孫難道都是克隆人？難道是來不及出現、採樣，就被隔離消滅了？

光是從時間爆發來看，的確像是武漢起源。當然真正的起源地可能已經爆發，只是當成流感來處理了。有些地方八十歲以上老人不夠，各種呼吸道病橫行，今年也看不出有什麼特別高的死亡率。而美國就算是起源地，是否會把新冠當成流感？難道美帝就沒有眼科醫生李文亮能慧眼識病毒，發出警告？我覺得可能性不高。

但大概率在下個月美國就是要把新冠當成流感來復工的，即使殊途也得同歸，沒差了。

 

[wilson111]

那個數學挺怪的，發生突變還需要發生一樣的突變 (如 A 換成 T 而不是換成 C 或 G)，而發生某種特定突變的機率，還要考慮進其他這麼多鹼基都沒突變的機率，這與與全體基因組總共有幾個鹼基對是沒有關係的。就像渥太華有一萬個肚子裡的嬰兒，與某個嬰兒有唐氏症，但沒其他毛病的機率是沒有關係的，假設是千分之一吧。而第二個嬰兒有唐氏症而沒其他毛病又是一樣的千分之一。也就是原文再用 1/29000 的意思了。

數學有問題，但道理應該是可以接受的，發生同樣突變的可能性低到可以忽略不計了。也就是這種基因測序分析可以推敲出來病毒的族譜。但研究的先決條件已經規定是武漢起源了。

另外，新冠病毒只有 15 個基因。一個基因幾百個胺基酸，一個胺基酸三個鹼基對，還有基因中間填充的鹼基對。所以一共三萬個 (29000?) 鹼基對。

每个人单独看概率和几个人一起概率不能这么看的。就像你说的，某个女的怀孕唐氏儿千分之一，她的闺蜜怀孕换怀唐氏儿的概率也依然是千分之一，但是这个妇女和她的闺蜜都怀上唐氏儿的概率就是千分之一的平方而不是千分之一。这跟扔硬币一样，每个硬币正反面和50％概率，但是显然10个硬币都扔成正面的概率不是50％.
这篇文章一个很重要的依据是，两种病毒可能没有父子关系，而他们在A点的突变概率都是1/29000，这个概率不算太小，所以这两个病毒可能没有父子关系，因为否定了潜在的0号病毒。但是如果说他们没有父子关系，就是独立事件，和扔硬币一样，两种病毒都选择了A点进行突变的概率就是两者的乘积，大概1亿分之1的概率，这个概率比中大奖都低多了，所以两种病毒不是父子的关系绝对是小概率事件。

 

[lfe634]

这跟扔硬币一样，每个硬币正反面和50％概率，但是显然10个硬币都扔成正面的概率不是50％.

用扔硬幣的框架，那麼就是｢兩個都扔正面｣，｢兩個都扔反面｣，這兩個都要算，果然還是 50%。

他這裡指的應該是普遍的｢突變到一起｣的情況，任何一次不相干的病毒突變到一起，都會影響到演化樹的正確性。

可以想像這樣的場景：
甲：我遺傳到色盲。色盲是百分之一的機率。
乙：【真巧啊】，我也遺傳到色盲。但我倆沒有親戚關係。

那麼社會上隨機抽出兩個人都有色盲，是萬分之一的機率。
但是社會上隨機抽出兩個人，因為都遺傳到某種百分之一的性狀而發出【真巧啊】的贊嘆，卻遠不只萬分之一。他們即使不都是色盲，也可能剛好都遺傳到血友病，或鐮刀紅血球，或肺部囊腫性纖維化。如果總共有三百六十五種遺傳性狀剛好都是百分之一的機率，那麼他們說出【真巧啊】的機率，就比萬分之一要高得多了。

不說【真巧啊】代表三百六十五種百分之一的遺傳性狀都要避開：

(0.99)^365 = 0.0255
所以至少說一次【真巧啊】的機率就是 1-0.0255 = 97.4% 是相當高的

高中數學好像還有｢全班 50 個小朋友，生日都不重覆的機率是多少？｣這種排列組合問題。
但這類【好巧啊】其實挺普遍的。
但是如果說要同日同小時同分同秒生，那樣的機率又很低了。
放回病毒這裡，就是說突變有好多可能，剛好發生同樣的突變，這個機率是很低的。這我們應該都是直覺上同意的，雖然沒真的算過。

 

[Jay Wang]

这贴顶起。楼上几位仁兄讲的很好，俺有点开窍了。

 

[向问天]

核酸中每个碱基的突变概率不是均等的。有些碱基突变概率高很多，即某些位点突变的概率会大大超出随机数。